エピジェネティッククロック(Epigenetic Clock)とは -II
2025.09 その他今回は、それぞれのエピジェネティッククロック(Epigenetic Clock)の技術的なお話の残りと、最皆さんが最も関心がおありと思う実際臨床での応用について述べたいと思う。
4. 測定技術と解析手法
エピジェネティッククロックの構築には、主に以下のようなメチル化解析法が用いられる:- Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip
- Illumina EPIC Methylation BeadChip(850K)
- Whole-genome bisulfite sequencing(WGBS)
CpGサイトのメチル化率(β値)を取得し、既存のモデル(Horvath, Hannumなど)に当てはめて解析するか、カスタムアルゴリズムを構築する。解析にはRやPythonなどでの機械学習・統計処理が必要であり、バッチ効果やノイズの補正も重要なステップとなる。